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新型液体活检开启了癌症检测的大门?

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  来自美国的一组研究发现,一种依靠人工智能检测血液中癌症的新方法,能够在迄今为止测试的大多数患者的单次液体活检中识别出七种不同的癌症类型,并在多达75%的病例中准确识别出起源组织。

  但是该研究也表明,该测试也被证明在健康对照中异常依赖,将少数健康患者错误分类为患有癌症。

  然而,这些数据来自早期概念验证研究,需要在前瞻性临床试验中进行验证,然后才能评估测试的真实临床效用,专家如此提醒。

  “现有的液体活检测试通常侧重于癌细胞内DNA序列的突变或甲基化变化,但不幸的是,并非所有癌症患者都有可以用这些方法检测到变化,而且通常[这些活检]非常有限,”约翰霍普金斯Kimmel癌症中心肿瘤学教授Victor Velculescu博士说。

  “相比之下,我们的想法是非常全面的,这在我们称之为无细胞DNA(cfDNA)的碎片特征的整个基因组中看起来很广泛,通过分析血液中的这些碎片特征,我们可以识别全基因组异常并避免许多与特定突变或其他因素有关的陷阱,”Velculescu指出。

  该研究于5月29日在线发表在“自然”杂志上。

  在简报会上,研究人员解释说,这项名为DNA早期拦截评估(DELFI)的新型测试首先进行了概念验证研究。它被训练用于检测来自208名患有乳腺癌,结肠直肠癌,肺癌,卵巢癌,胰腺癌,胃癌或胆管癌的患者的血液样品中的癌症的存在。与会者来自美国,丹麦和荷兰。

  对来自215名健康志愿者的血液样品也使用相同的测试。

  正如Velculescu所解释的那样,健康细胞的细胞核将DNA包装成一个“组织良好的手提箱”,其中基因组的不同区域被小心地放置在不同的隔间中。

  “相比之下,癌症细胞的细胞核更像是杂乱无章的手提箱,随着整个基因组的物品随意抛出,”他指出。

  由于癌症基因组在包装方式上处于混乱状态,“我们发现,当癌细胞死亡时,它们会以混乱的方式将碎片化的DNA释放到血液中,”Velculescu继续说道。

  通过检查cfDNA,DELFI能够根据包装的方式检测基因组不同区域DNA的大小和数量异常。

  使用这种新颖的液体活检方法,研究团队能够在73%的癌症患者中检测到癌症,并且将215名健康志愿者中仅有4名患者误诊为患有癌症,使得该检测具有98%的特异性。

  重要的是,所分析的大多数癌症样本都是适合手术切除的早期癌症,“这项测试的一个非常重要的特征,因为如果你只是看着晚期疾病,显然这种测试几乎没有那么有用,”Velculescu观测到的。

  由于全基因组碎片模式也揭示了与特定组织相关的差异,因此碎裂模式也可以指示癌症的来源,例如乳腺癌,结肠癌或肺癌。

  例如,在目前的分析中,发现DELFI在鉴定cfDNA起源组织方面准确率为61%至75%。

  “这实际上意味着,当你将来接受这样的测试时,你会首先得到一个结果,说这是一个积极的测试 - 这是一个癌症信号 - 但是知道癌症来自哪里非常重要因为这会影响你对待病人的方式,“Velculescu说。

  “因此,该测试的一个好处是,它也可以告诉您肿瘤似乎来自的大部分情况,然后可以帮助集中后续的诊断测试和最终干预,”他补充说。

  Velculescu表示,他们的国际研究团队正在扩大分析范围,他们希望研究DELFI在数千人中的表现。

  然而,这种新技术的潜力已经“非常鼓励”它们,因为它看起来完全独立的DNA特征集,而不是那些多年来对研究界极具挑战性的DNA特征。

  最快的是,Velculescu设想DELFI用于高危患者群体,如吸烟者或遗传易患癌症的患者,其中98%的检测特异性仍然有助于癌症高危人群。

  另一方面,测试不应该证明是昂贵的,他补充说,因为它很容易管理,只需要目前可用,廉价的实验室方法来提供结果。

  “因此,我们预计DELFI将比其他癌症测试更具成本效益,”Velculescu认为。


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